Hola marcela, no se si entendi bien, pero ahi va mi respuesta...
Tenes que crear bancos propios, y a cada banco le podes asiganar cuantas cuentas queiras. A cada cuenta le corresponde un ID diferente, y imputaciones a cuentas contables diferentes para luego poder hacer la conciliacion.
Podes crear el bco con Tx FI12, luego con la FBZP, en Bancos propios podes configurar las cuentas bancarias.
Espero te sirva
Saludos
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