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Hola.
No soy Basis pero muchas veces por integridad del sistema se limita, a nivel el tamaño de memoria que puede consumir un usuario en un proceso o transacción.
Si tu archivo es muy pesado y cada registro tiene una funcion; al leerlo y procesarlo va a seguir existiendo la posibilidad que se vaya a dump o error de proceso. No te escaparias de hablar con los chicos Basis.
Una opcion dependiendo de tu programa es hacerlo por job, que el job corra el programa que carga el archivo y asi no tronaria por tiempo. Igual depende de la configuracion basis del sistema.
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