Hola para registrar esta factura hay varias formas de hacerlo, si se registra por FI a traves de la transacción FB60 lo mas comun es colocar una posicion de duenta de mayor por cada indicador de impuestos; se debe verificar a traves de la transaccion FB00 si el flag de calcular impuesto sobre importes netos, de no ser asi el importe colocado en la posicion de la cuenta de mayor debe comprender el iva a calcular.
si se registra a atrves de la transaccion MIRO lo mas comun es que exista una posicion en el pedido por cada servicio afecto a cada indicador de impuestos, si esto no es asi tambien existe la alternativa de postear directamente a las cuentas de mayor de impuestos dentro de la pestaña cuenta de mayor (para que esta pestaña se visualice debe estar configurada en el customizing)
espero te sirva de ayuda
Saludos...
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