[Opereas]

Claro que es posible, solo debes asegurarte como ya te lo han diho antes:
1. Coloca en "0" es stock del item en cuestión (para esto hay varias formas de hacerlo, pero básicamente lo harás con un traspado de stock a otro material con la misma unidad de medida y un costo similar) (Tc MIGO)
2. Todos los documentos que esten activos, los debes marcar para borrados (si son posiciones) y/o cancelar.
3. Cambia la unidad de medida base a la que necesitas
4. El resto de los nuevos movimientos a ese material, serán en la unidad de medida nueva.

Pregunta: Ya trataste de solucionar esto con unidades de medida alternativas?