Hola Carmen.
Si ya hiciste la factura del material a los cuales le repartiste el total del coste asociado (aumentando el valor de compra), para la segunda factura del transporte creo que ya no debes repartir nada puesto que todo ese coste es un gasto que irá a una cuenta xxx de gasto de transporte que tú debes indicarle, ¿no?. Si no he entendido mal creo que así finalizaría el proceso.
Espero haberte ayudado.
Un saludo.
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