Hola
Mira una cosa es como comiences el encabezado y otra muy diferente como este codificado el archivo.
Mi sugerencia es la siguiente descarga el Notepad++ y observa bajo que esta codificado(osea entra a alguno de los archivos con problemas) y dejalos a todos a la misma codificación que necesitas que interprete quien toma el archivo.
Ya que lo que esta pasando es que a vos más allá que le pases en el encabezado que lo interprete como UTF-8 la codificación del archivo esta en otro formato y conociendo a SAP te lo paso a UTF-16 cuando realizaste la exportación.
Espero que la data te sirva.
Saludos.
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